Des renouvellements bidimensionnels pour modéliser l’ADN: phénomènes de dénaturation et de condensation

par Quentin Berger

jeudi 11 mai 2017, 14:00 → 15:00 Europe/Paris

La Doua, ICJ, Bât. Braconnier, Fokko du Cloux

Le modèle de Poland-Scheraga, introduit en 1970 pour décrire le phénomène de dénaturation de l’ADN, a été largement étudié ces 40 dernières années aussi bien dans la littérature physique que mathématique. Plus récemment, une version généralisée de ce modèle a été considérée, notamment d’un point de vue mathématique par Giacomin et Khatib, afin de faire face aux limitations du modèle originel (qui supposaient que les deux brins étaient de longueur égale et parfaitement alignés). On décrira dans cet exposé le modèle de Poland Scheraga généralisé, qui se base sur des processus de renouvellement bidimensionels pour décrire les ‘boucles’ présentes dans l'ADN. On caractérisera la transition de dénaturation (i.e. lorsque les deux brins d’ADN se décrochent), et on soulignera l’existence d'une transition dite de condensation (i.e. l’apparition d’une boucle macroscopique), absente du modèle originel. Travail en collaboration avec G. Giacomin et M. Khatib