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Dans cet exposé nous nous intéresserons à un modèle d'épidémiologie du type SIS avec deux niveaux d'infection et N souches (variant) de l'agent infectieux. En général l'étude qualitative de ce modèle est hors de portée, excepté dans un cas particulier dit "Neutre" dans lequel toutes les souches sont identiques. Nous étudierons une perturbation "Quasi-Neutre" du cas Neutre. Nous verrons comment ce système quasi-neutre peut s'étudier à l'aide de séparations d'échelles de temps. Nous montrerons que la dynamique lente est gouvernée par un système du réplicateur - sur les fréquences des souches - et comment ce système plus classique permet d'obtenir en retour des informations sur le système épidémiologique initial.
Vincent Perrollaz