Introduction aux méthodes de découverte d'équation et utilisation dans un contexte biologique
par
Salle Fokko Du Cloux
Batiment Braconnier la Doua
Les astrocytes sont des cellules gliales du système nerveux central, connectées à des milliers de structures neuronales. Longtemps considérées comme des cellules de soutien, des études récentes ont révélé qu'elles jouent un rôle actif dans la transmission du signal mais restent encore largement incompris. Je m'intéresse en particulier au signal calcique astrocytaire, dont une grande partie se produit dans des prolongements trop fins pour être visualisés avec les microscopes actuels, ce qui rend la modélisation nécessaire.
Ma thèse adopte une approche basée sur les données : plutôt que de partir d'hypothèses sur les mécanismes biologiques sous-jacents, nous cherchons à découvrir directement une EDP gouvernant la dynamique calcique à partir du signal lui-même en utilisant des méthodes de découverte d'équation. L'objectif est d'obtenir des équations interprétables permettant de mieux comprendre les dynamiques calciques.
Dans cette présentation, je commencerai par introduire les méthodes de découverte d'équations et dresser un état de l'art de ce domaine. Je présenterai ensuite un benchmark de cinq de ces méthodes, puis les expériences que nous avons menées avec la méthode WSINDy sur des données simulées.
Ces travaux constituent une première étape vers l'application de ces méthodes à des données biologiques réelles, avec pour objectif à terme de mieux comprendre l'impact de pathologies sur les signaux calciques.