Journée Doctorant·e·s Rennais·e·s en Statistique - 2024

Session

Statistiques appliquées : Biologie

18 mars 2024, 11:00

Amphi Lebesgue (IRMAR)

10. Prédiction de l'expression des gènes à partir de données épigénomiques chez le Fusarium à l’aide de méthodes de machine learning et de Deep Learning

Mme Mathilde Bruguet (Institut Agro, MycSA)

18/03/2024 11:00

Le Fusarium est un bioagresseur du blé, connu pour ses capacités d’adaptation rapide aux changements environnementaux, dues à des variations épigénétiques. À des intervalles de temps courts, les variations épigénétiques peuvent permettre des changements phénotypiques dûs à la modification de l’expression génique, sans changement de la séquence génomique. Ainsi, les génomes et épigénomes...

9. Wheat Fusarium Head Blight (FHB) evolution with climate change: an ecological modelling approach of competing fungal species

Dr Rémi Mahmoud (INRAE)

18/03/2024 11:20

Fusarium head blight (FHB) poses a significant threat to wheat production and food safety. Various fungal species within the Fusarium genus are responsible for FHB and compete with each other. Understanding the ecophysiology of these species is crucial for predicting their distribution with climate change in France.
In our study, we analyzed data from an in vitro experiment involving 25...

8. Absence et présence d'une espèce dans un écosystème, modélisation et inférence

M. Guillaume Franchi (ENSAI/CREST)

18/03/2024 11:40

Déterminer si une espèce sera présente ou absente d'un écosystème à un moment donné est une question centrale en écologie, tant elle peut déterminer la bonne santé de cet écosystème, ou sa dynamique dans le temps. On propose ici de modéliser cette absence/présence par une version temporelle du modèle de régression probit multivarié. Les paramètres de ce modèle sont facilement interprétables,...

15. Study of the onset of the first arrest among telomere lineages and the various paths to senescence

M. Hugo Martin

18/03/2024 12:00

In this talk, I will first introduce what are telomeres, and the experimental design used to produce the data of single of telomerase negative yeast lineages.Such lineages display precocious abnormally long cell cycles, that occure earlier than the fatal phase of replicative senescence. Then I will present two models to predict and understand the onset of the first long cycle. Finally, I will...