Analyse d'un processus markovien déterministe par morceaux modélisant la dynamique de l'expression des gènes

par Elias Ventre

mardi 1 févr. 2022, 15:45 → 16:30 Europe/Paris

Fokko du Cloux (Bâtiment Braconnier, Université Lyon 1)

La différenciation est le processus par lequel une cellule se spécialise
par l'expression stochastique de certains gènes au cours du temps. Ce
processus résulte du fonctionnement dynamique d'un réseau de régulation
des gènes (GRN) exprimant la manière dont le produit de l'expression des
gènes (les protéines) influent sur l’expression elle même. A partir
d'une modélisation mécaniste de la différentiation sous la forme d'un
processus markovien déterministe par morceaux, je montrerai comment une
analyse de type grandes déviations permet de relier la structure d'un
GRN à la dynamique d'un processus réduit entre types cellulaires, et
comment cette réduction peut servir à résoudre le problème inverse
d'identifier un GRN à partir de données biologiques.