Un modèle de réseau phylogénétique par branchement-coalescence

par François Bienvenu (ETH Zürich)

mardi 26 sept. 2023, 14:15 → 15:15 Europe/Paris

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Les phylogénies (c'est-à-dire les relations évolutives entre les 
espèces) sont généralement représentées au moyen d'arbres. Pourtant, les 
arbres ne sont pas adaptés à la modélisation de phénomènes comme les 
transferts horizontaux de gènes ou les hybridations. Cela conduit donc 
les biologistes à se tourner de plus en plus souvent vers l'utilisation 
de réseaux pour modéliser les phylogénies. Néanmoins, à ce jour peu de 
modèles de réseaux phylogénétiques aléatoires ont été étudiés 
mathématiquement. Cet exposé présente un premier modèle très simple de 
réseau phylogénétique associé à un processus où des espèces peuvent non 
seulement se diviser, mais aussi fusionner. Nous verrons comment des 
méthodes de processus de branchement peuvent être utilisées pour étudier 
ce genre de modèles -- mais aussi les difficultés qui devront être 
surmontées pour permettre d'adapter cette approche à des modèles plus 
réalistes du point de vue biologique.