Une isomérisation est une réaction chimique lors de laquelle une molécule est transformée en une autre om les mêmes atomes sont disposés différemment. Je commencerai par présenter les modèles mathématiques de molécules puis montrerai que, dans un cadre non relativiste, le chemin d'isomérisation optimal est toujours borné. Enfin, je présenterai mes résultats qui concernent le cas où les électrons sont considérés comme relativistes. Ce travail a été effectue en collaboration avec Ioannis Anapolitanos (Karlsruhe) et Marco Olivieri (Copenhague).